@article{1,
abstract = "Sclerotium rolfsii est un champignon du sol causant la fonte de semis et la pourriture au collet des cultures
comme le soja, résultant en une perte énorme de rendement. Les sclérotes du champignon durent
longtemps dans le sol même en absence de l’hôte, rendant le contrôle de la maladie souvent difficile.
L’objectif de l’étude était de déterminer les bactéries colonisant les sclérotes du champignon en sol
inondé et l’effet de l’inondation sur l’incidence de la maladie causée au soja semé après retrait de l’eau.
En plein champ, le sol a été amendé de matière organique, inoculé avec le pathogène, et ensuite inondé
pendant 30 jours. Toutefois, avant l’inondation, les sclérotes en sachet ont été enterrés sur les parcelles.
Ces sclérotes récupérés du sol après inondation ont été examinés pour leur viabilité et la détermination,
sur la base de la réaction en chaîne par polymérase ou l’amplification en chaîne par polymérase (PCR)-
électrophorèse du gradient de gel dénaturant (DGGE) du 16S ARNr, des bactéries colonisant les
sclérotes. Les résultats ont montré que le modèle de bandes de DGGE a donné la plus large diversité de
bactéries à partir des échantillons de sclérotes récupérés du sol amendé et inondé. L’indice de diversité
des bactéries à partir des bandes de DGGE dans ces conditions inondées est supérieur à 1,80, comparé
à celui obtenu dans les conditions de sol non inondé. Par exemple cet indice est de 2,27 ± 0,18 sur sol
amendé avec de son de blé et inondé alors qu’il n’est plus que de 1,74 ± 0,19 sur sol non amendé non
inondé. Par ailleurs, plus l’indice est élevé, plus la viabilité des sclérotes est faible de même que
l’incidence de la maladie de fonte de semis et de pourriture au collet du soja. L’analyse des séquences
16S ARNr obtenues des bandes de DGGE révèle que les bactéries de la famille des Clostridiaceae sont
les plus dominantes dans les échantillons de sclérotes récupérés du sol inondé. Cette étude ouvre des
perspectives de réduction de l’inoculum initial par une inondation des parcelles infectées par S. rolfsii
pendant quelques semaines avant le semis.
Mots Clés : PCR, DGGE, diversité, sclérotes, soja, inondation du sol.",
author = "Adandonon A. and Momma N. ",
journal = "Bulletin de la Recherche Agronomique du Bénin (BRAB)",
month = "Juin",
number = "77",
pages = "33-46",
title = "Les Clostridiaceae réduisent l’incidence de Sclerotium rolfsii sur soja après inondation, révélé par la réaction en chaîne par polymérase (PCR)-électrophorèse du gradient de gel dénaturant (DGGE)",
url = "http://www.slire.net/download/2278/article_4_pg_brab_n_77_juin_2015_adandonon_et_nomma_clostridiaceae_r_duisant_incidence.pdf",
year = "2015"
}