Polymorphismes mononucléotidiques associés aux caractères du lait chez les bovins Borgou et Zébu Mbororo blanc au Bénin
- Abstract
- La β-lactoglobuline du lait (MBLG) est un gène candidat important pour les caractères de production laitière chez les bovins. Cependant, les effets des polymorphismes de ce gène sur les caractères du lait n'ont jamais été étudiés chez les races bovines indigènes Borgou et Peuls blancs au Bénin. Le but de l'étude était d'évaluer les polymorphismes mononucléotidiques du gène MBLG et leur association avec les caractères de production laitière des races bovines Borgou et Mbororo blanc au Bénin. Ainsi, l'exon IV partiel et l'intron IV de MBLG ont été séquencés chez 76 vaches Borgou et 90 Mbororo blanc en utilisant la méthode de séquençage de Sanger. Les teneurs en matières grasses du lait et en solides totaux ont été analysées à l'aide du spectromètre infrarouge MilkoScan FT 6000. Les résultats ont montré que deux SNP, MBLG g.5864C> T et MBLG g.5940G> A ont été détectés respectivement dans l'Exon IV et l'Intron IV du gène MBLG. La mutation MBLG g.5864C> T a conduit au changement de l'acide aminé alanine par la valine en position 118 dans la protéine résultante. Au locus MBLG g.5864C> T, l'allèle C était le plus fréquent avec des fréquences de 0,84 et 0,94 respectivement chez Borgou et Mbororo blanc tandis qu'au locus MBLG g.5940G> A, l'allèle G était le plus fréquent avec des fréquences de 0,92 et 0,88 respectivement chez Borgou et Mbororo Blanc. Les SNPsMBLG n'ont montré aucune association significative avec les caractères de production laitière chez les bovins Mbororo blancs. Cependant, le génotype AG du MBLGc hez la race Borgou était significativement associé à des teneurs plus élevées en graisses (6,8% vs 4,6% vs 4,5%, P <0,05) et en solides totaux (16,8% vs 13,7% vs 13,5%, P <0,05) par rapport aux génotypes AA et GG, respectivement. Le SNP identifié avec une association significative avec les caractères de production laitière peut servir de marqueur génétique pour améliorer les caractères de production laitière dans la race bovine Borgou au Bénin. Cependant, des études d'association à l'échelle du génome sont nécessaires pour mieux comprendre les régions génomiques et les gènes candidats associés aux caractères de production laitière chez les races bovines indigènes du Bénin.
Mots clés : SNPs, β-Lactoglobuline du lait, Caractéristiques du lait, Borgou, Mbororo blanc.
- English abstract
- Milk β-Lactoglobulin (MBLG) is an important candidate gene for milk production traits in cattle. However, the effects of MBLG polymorphisms on milk traits have never been investigated in indigenous Borgou and White Fulani cattle breeds in Benin. The aim of the study is to assess the single nucleotide polymorphisms in MBLG gene and their association with milk production traits in Borgou and White Fulani cattle breeds in Benin. Thus the partial exon IV and intron IV of MBLG was sequenced in 76 Borgou and 90 White Fulani cows using Sanger sequencing method. The milk fat and total solids contents were analyzed using MilkoScan FT 6000 Series mid-range infrared spectrometer. The results showed that two SNPs, MBLG g.5864C>T and MBLG g.5940G>A were detected respectively in Exon IV and Intron IV of MBLG gene. The MBLG g.5864C>T mutation led to the change of amino acid alanine by valine at position 118 in the resulting protein. At the MBLG g.5864C>T locus, C allele was the most frequent with frequencies of 0.84 and 0.94 in Borgou and White Fulani respectively while at the MBLG g.5940G>A locus, the G allele was the most frequent with frequencies of 0.92 and 0.88 in Borgou and White Fulani respectively. The MBLG SNPs did not show any significant association with milk production traits in White Fulani cattle breed. However, the MBLG AG genotype in Borgou breed was significantly associated with higher fat (6.8% vs 4.6% vs 4.5%, P<0.05) and total solids (16.8% vs 13.7% vs 13.5%, P<0.05) contents compared to AA and GG genotypes, respectively. The identified SNP with significant association with milk production traits can serve as a genetic marker to improve milk production traits in Borgou cattle breed in Benin. However, genome-wide association studies are needed to better understand genomic regions and candidate genes associated with milk production traits in Beninese indigenous cattle breeds.
Keywords: SNPs, Milk β-Lactoglobulin, milk traits, Borgou, White Fulani.